460 artigos
O RegEvol é uma nova abordagem que detecta seleção direcional em sequências regulatórias ao integrar previsões de ligação de fatores de transcrição baseadas em aprendizado de máquina com modelos evolutivos explícitos, permitindo identificar adaptações em regiões não codificantes de *Drosophila* e humanos com maior precisão estatística.
Este estudo demonstra que o abanar da cauda em beija-flores funciona como um sinal agonístico de intenção agressiva durante disputas entre machos, sendo realizado com ângulos significativamente maiores em confrontos do que em manobras de voo solitário.
Este estudo demonstra que a restrição da diversidade de aminoácidos, simulando as condições da Terra primitiva, pode remodelar o sítio ativo de uma enzima ancestral, substituindo sua atividade catalítica original por uma reação alternativa de transferência de fosforila que converte ADP em ATP e AMP.
Este artigo propõe um modelo evolutivo geral, fundamentado em redes reguladoras gênicas hierárquicas e validado por simulações genéticas de populações, que explica como a seleção natural e as restrições de desenvolvimento interagem para impulsionar a emergência de novidades morfológicas a partir da divergência de homólogos seriados.
Este estudo reanalisa marcadores genéticos uniparentais para propor que a colonização das Américas ocorreu antes do Último Máximo Glacial, com as principais expansões demográficas pós-glaciação originando-se na América do Sul em vez da América do Norte.
Este estudo demonstra que a multicelularidade simples em leveduras pode ser mantida não por uma vantagem direta do fenótipo multicelular, mas como um "fenótipo passageiro" que persiste porque a mutação genética subjacente (ace2) confere uma vantagem seletiva em condições que afetam a transição G1/S do ciclo celular, acelerando a saída da quiescência.
Este estudo demonstra que o mimetismo mülleriano em *Heliconius* constitui um contínuo dinâmico e estruturado espacial e perceptualmente, moldado pela convergência local, pela visão específica do predador e por processos evolutivos assimétricos, em vez de ser composto por anéis discretos e perfeitamente recíprocos.
Este estudo demonstra que a esterilidade masculina citoplasmática no caramujo *Physa acuta* está associada a alterações na respiração do complexo I mitocondrial nos indivíduos estéreis e a um custo energético elevado nos indivíduos restaurados, evidenciando um conflito mitonuclear que impacta o metabolismo aeróbico.
O artigo apresenta o SplitAligner, uma nova estrutura computacional que alinha árvores gênicas a uma árvore de espécies fixa mapeando divisões (splits) para resolver problemas de concordância e cobertura taxonômica, permitindo assim a geração de tabelas padronizadas e a análise de taxas evolutivas e restrições seletivas em nível de ramo.
Este artigo apresenta um modelo de ocupação filogenético que integra modelos ecológicos e evolutivos para inferir a presença de genes em genomas incompletos, superando métodos existentes ao estimar simultaneamente a completude do genoma e a probabilidade de genes não observados, com o código disponibilizado em um pacote Python.
Este estudo demonstra que, em nematoides *Caenorhabditis elegans*, a defesa contra parasitas está correlacionada com o momento da reprodução e não com a resistência à infecção, indicando que a seleção natural favorecerá a evolução de características de história de vida em vez de mecanismos de resistência.
Este estudo utiliza transcriptômica de célula única para demonstrar que a expressão gênica enviesada por sexo nos circuitos neurais de *Drosophila* é limitada, específica de tipo celular e altamente dinâmica durante o desenvolvimento, revelando que a adaptação sexual ocorre principalmente através de programas gênicos localizados em nós específicos do circuito, preservando assim a evolução dos circuitos compartilhados apesar do forte acoplamento transcricional entre os sexos.
Este estudo revela como mudanças ecológicas e climáticas históricas impulsionaram a evolução do órgão respiratório protorácico em dípteros através de um modelo passo a passo de co-optação hierárquica de redes reguladoras gênicas, conectando eventos geoclimáticos à origem de novidades morfológicas.
Este estudo demonstra que a evolução do tamanho corporal em sistemas predador-presa explorados é impulsionada conjuntamente pela seleção direta da pesca e por mudanças indiretas na estrutura da comunidade, onde a evolução das presas pode garantir a resiliência dos predadores, reforçando a necessidade de integrar a evolução na gestão pesqueira baseada em ecossistemas.
Este estudo demonstra que, embora a evolução frequentemente aumente a robustez das redes tróficas sob pressão pesqueira, estratégias de pesca que concentram o esforço em níveis tróficos inferiores ou distribuem-no de forma mais uniforme são essenciais para promover o resgate evolutivo e evitar o colapso da rede, revelando um compromisso entre a diversidade vertical e a totalidade da biodiversidade.
Este estudo demonstra que a acidificação dos oceanos pode levar a uma evolução que reduz a capacidade de calcificação do fitoplâncton, alterando a transferência de energia nas redes alimentares e comprometendo a estabilidade da bomba de carbono.
Este estudo utiliza simulações e dados populacionais de *Drosophila melanogaster* para demonstrar que, embora as mutações em regiões regulatórias sejam predominantemente moderadamente deletérias (diferentemente das fortemente deletérias em regiões codificantes), elas contribuem com a maioria das novas mutações deletérias e substituições benéficas no genoma, sendo essenciais para uma compreensão precisa da seleção natural e da variação genômica.
Este estudo apresenta uma análise bioinformática abrangente que sugere que o GCR1 é o único receptor acoplado à proteína G genuíno expresso em embriófitas, discutindo também seu papel potencial no desenvolvimento e interação ambiental dos pelos radiculares.
Este estudo demonstra que genes pleiotrópicos envolvidos nos sistemas neuronal e imune de *Drosophila melanogaster* apresentam taxas evolutivas mais lentas, mas sugere que a taxa de evolução (dN/dS) é um preditor mais forte de associação com doenças neurológicas humanas do que a própria pleiotropia.
Este estudo revela que o acoplamento estrutura-função no cérebro humano difere do do macaco ao apresentar padrões distintos em regiões pré-frontais e temporais, sendo impulsionado por adaptações moleculares em genes relacionados à função sináptica e a células gliais, o que oferece insights sobre a base neural das capacidades cognitivas únicas dos humanos.